國家政策的制定和落實對于環保產業有著至關重要的影響。目前國家對于環保產業的發展和公共基礎設施的建設十分重視，也推出了諸多政策推動產業發展，但是同時也坦言，不同政府部門之間的政策還需進一步統一和明確，同時完善補貼機制，推動產業更加高效發展。

中投顧問在《2016-2020年中國大氣污染防治產業投資分析及前景預測報告》中提出，環保產業很多都是直接向政府和國有企業提供服務的產業，它的所有風險和交易結構都取決于甲方，取決于甲方的信譽、成熟度、付費意愿、資金充裕程度以及對這個產業的理解，甲方有沒有足夠的資金來采購，是否愿意來采購，提供什么樣的標準，這是環保行業面臨的一大挑戰。

與此同時，國內污染治理市場次第打開，各個細分行業、新興領域加速成型發展。在這一過程中，產業對技術、對管理水平提出更高要求，環保企業的專業競爭力和綜合實力將面臨考驗。

環保細分領域眾多，門檻高低不一，那些確立平臺型發展戰略的環保企業，未來可望獲得更大發展空間，資產并購或成為這些企業拓展新領域的重要手段。

環保產業發展面臨另外一個重要挑戰還來自于公眾的非理性情緒。公眾和社會對水價、水質、水污染、選址、垃圾焚燒、地溝油的關注和質疑，正在快速抬高環境服務的標準，而服務價格跟不上服務標準提高的步伐，也是當前環保產業需要解決的重要問題。