CO2捕捉過程中將會給環境帶來非常嚴重的污染，主要是由于耗能必然耗費大量的能源，焚燒大量的燃料，也就表示會產生大量的NOx、SO2等其他污染物；另外，也會耗費大量的化學藥品，如氨和石灰石等，控制NOx、SO2排放的耗費也將會上漲。并且，為了便于捕獲的CO2的運送和儲存，要對其實行高濃度壓縮。對于壓縮設備有嚴格的標準，是因為壓縮過程存在很大的風險，威脅了工作人員的人身安全。